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Das Zentrum ist fachlich der Kinder- und Jugendpsychiatrischen Klinik (KJPK), einer Abteilung der Universitären Psychiatrischen Kliniken (UPK) Basel, angeschlossen. Die operative Leitung des Therapiezentrums liegt bei Dr. med. Evelyn Herbrecht, Leitende Aerztin an der Kinder- und Jugendpsychiatrischen Klinik Basel-Stadt. Das Therapiezentrum arbeitet interdisziplinär und wird von Mitarbeitenden der Fakultät für Psychologie der Universität Basel wissenschaftlich unterstützt.